Bis 40% Mehrleistung kann man grundsätzlich eintragen. Nur einbauen und auf die MFK fahren geht aber dann doch nicht, oder zumindest nicht mehr. Da eine andere Auspuffanlage verwendet wird, wird heute meistens ein Lärmgutachten verlangt, wenn man Pech hat auch noch ein Abgasgutachten. Es kommt aber stark auf die MFK an, einige sind strenger, andere weniger.
Der C6 ist im Prinzip ein werksgetunter C4, von da her auf jeden Fall besser was die Performance anbelangt.
Zu den geplanten Massnahmen kann man so nicht viel sagen, es komm stark drauf an, was du genau haben möchtest. 
Möchtest du einen standfesten Motor, der als Daily eingesetzt werden kann, dann bist du sicher mit einem "Serienmotor" am besten bedient, also ITR-Kopf auf den C4-Block mit den entsprechenden C6-Kolben, Kurbelwelle muss nicht zwingend gewechselt werden, die vom C6 soll zwar wegen der höheren Drehzahlen etwas schwerer sein, aber wenn die vom C4 feingewuchtet wird, dann kann man problemlos bis 9'000 drehen, wie es mit den Pleuel aussieht müsste man abklären.
Wenn du einen scharfen Sauger willst, dann wären hochverdichtete Schmiedekolben mit entsprechenden Pleuel in Verbindung mit einem bearbeiteten Kopf, grösseren Ventilen, scharfen Nockenwellen mit entsprechendem Ventiltrieb, grössere Ansaugbrücke/Drosselklappe sicher das nonplusultra. Da wird aber die Laufleistung und die Charakter nicht unbedingt dailymässig sein 
So oder so ist dieses Tuning dann aber nicht legal, dann kann man auch gleich einen B18C6 einbauen und die Nummer auf dem Block auf B16A1 abändern.